Das "Problem" fehlender Dateien ist mir auch schon (jedoch selten) bei meinen HB Projekten gemeldet worden.
Wobei ich mich dann frage, warum man denn nur eine Datei (in dem Fall die .ino) aus dem Ordner pickt und die andere(n) Datei(en) nicht mitnimmt?
Die Fehlermeldung besagte sogar, dass genau diese Datei, die in dem Ordner läge, wenn man einfach das komplette Projekt kopiert, fehlt